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1、種子種苗的提純復壯和優良種品選育工作滯后，造成中藥材的質量不穩定。中藥飲片批發介紹由于大多數藥用植物引種栽培歷史較短，因此保留著許多野生性狀，栽培的中藥材種質混雜，表現為種內變異的多樣性。種子種苗的提純復壯和優良品種選育工作不及時，是造成中藥材質量極不穩定的主要原因。
2、中藥材中農藥殘留、有害重金屬含量超標。在栽培過程，中藥材往往遭受到多種病蟲病的危害，直接影響中藥材的產量和質量，造成重大經濟損失。中藥材中的農藥殘留問題，直接影響人體健康，阻礙中藥走向國際市場。某些中藥材生長地區受到工業廢液、廢氣等嚴重污染；有些中藥材在生長過程中富集有害元素，導致重金屬含量超標。
3、不合理的開發利用，野生資源消耗速度過快。當前對野生中藥材資源保護措施不力，受價格和市場等因素的影響，常遭掠奪性開發，導致毀滅性破壞，如肉蓯蓉、川貝母、石斛、穿龍薯蕷，冬蟲夏草等。中藥飲片批發廠家介紹由于環境惡化，生態平衡失調，有些藥用植物分布區域縮小，甚至減少到物種滅絕的邊緣。
